Tuberculosis
Los miembros del Centro colaboran activamente con el grupo de investigación del Dr. Carlos Martín, con la participación del Dr. Ignacio Aguiló y Santiago Uranga en la creación de una vacuna frente a la tuberculosis humana, que se encuentra en un estado muy avanzado de desarrollo. Estos experimentos se realizan en ratones que se encuentra ubicados en la zona de mayor nivel de bioseguridad del ratonario. En sus trabajos cuentan con la colaboración activa de personal del Centro, que se han plasmado en publicaciones científicas.
Enfermedades vectoriales
Otra línea de investigación que se desarrolla también en el Centro es el estudio de enfermedades vectoriales transmitidas por distintas especies de mosquitos. Entre estas cabe destacar la Lengua Azul, enfermedad vírica que afecta a rumiantes de gran trascendencia para la sanidad animal, que ha afectado a España y otros países europeos en la década pasada y que ha vuelto a reemerger de nuevo en este año 2015. Estos estudios están dirigidos por el Dr. Javier Lucientes, reconocido experto nacional en el tema y asesor especial del Ministerio de Agricultura para la lucha entomológica. La otra enfermedad vectorial cuyos estudios cuentan con la participación del Centro, es la Leshmaniosis canina dirigida por el Dr. Juan Antonio Castillo, y que tienen como objetivo el desarrollo de una vacuna frente a la misma, en colaboración con el Centro de Biología Molecular del CSIC de Madrid y con la empresa CZ Veterinaria. El Centro dispone de un mosquitario construido con el apoyo económico de proyectos y contratos destinados a la financiación de esas líneas de investigación.
Toxoplasmosis
Se han iniciado estudios en el Centro sobre la capacidad de transmisión de Toxoplasma gondii, un protozoo patógeno compartido por animales y personas, a través de productos cárnicos, cuyas responsables son las Dras. Susana Bayarri y María Jesús Gracia.